Изучение пространственной организации генома стало важной областью современной молекулярной биологии. В отличие от человека и других сложных организмов, для бактерий связь между архитектурой ДНК и регуляцией генов оставалась недостаточно исследованной. Исследователи из МГУ в сотрудничестве с коллегами впервые создали высокоразрешающую 3D-карту генома кишечной палочки, что открывает новые перспективы в науке и медицине. Для этого они адаптировали метод Микро-С, ранее использовавшийся в основном для эукариот, что позволило детально изучить взаимодействия ДНК на расстоянии 10 пар нуклеотидов. Это дало возможность выявить ранее неизвестные структуры — «шпильки», которые играют значительную роль в регуляции генов. Эксперименты показали, что «шпильки» отключают гены, переданные горизонтальным переносом, а их взаимодействия сближают участки хромосомы. Удаление поддерживающих белков активирует «спящие» гены. В зонах активных оперонов хромосома образует домены, упрощающие взаимодействие с РНК-полимеразой, что способствует высокой экспрессии генов. По словам Сергея Разина, эти данные могут помочь в понимании механизмов передачи генов, отвечающих за устойчивость к антибиотикам.